När katolska kyrkan flyttar in i en av Vaxholms mest populära byggnader, blossar en infekterad konflikt upp mellan protestanter och katoliker.
Vid samma tid hittas en kvinna mördad i ett av rummen på Waxholms hotell. Ett omfattande polisarbete drar i gång för att hitta den skyldige samtidigt som man söker efter den döda kvinnans anhöriga, men hon tycks helt sakna familj och mannen hon delade rum med är försvunnen.
Skärgårdstidningens chefredaktör Angelica Moe intresserar sig för fallet och hon försöker ta reda på vem den döda kvinnan egentligen var. Spåren leder henne in i kyrkans värld och den döda kvinnan visar sig snart ha en nära koppling till henne själv.
Röd bikt är den femte, fristående delen i serien om Angelica Moe och Vaxholmspolisen.